來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-3-15 17:24:49
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人類泛基因組首張草圖發(fā)布

人類泛基因組首張草圖發(fā)布 圖片來(lái)源:Gideon MendelCorbis via Getty

  2023年5月10日,《自然》發(fā)表了人類泛基因組參考的“初稿”。在3篇論文的合集中,人類泛基因組參考聯(lián)盟發(fā)布了首張人類泛基因組參考草圖以及兩個(gè)以這一參考圖為基礎(chǔ)的新遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn),為人類基因組提供了更為完整的圖像。

  自2001年發(fā)布草案以來(lái),人類參考基因組一直是人類基因組的支柱。但由于結(jié)構(gòu)變異和替代等位基因的存在,有些單個(gè)基因組無(wú)法代表人類物種的遺傳多樣性。與此前不同,人類泛基因組草圖是包括非洲、亞洲、美洲和歐洲的全球多地多人的脫氧核糖核酸(DNA)合集,地域和種族構(gòu)成更多元化。

  此次,在論文合集中,人類泛基因組草圖開(kāi)發(fā)自47名祖先不同個(gè)體的陣列,為當(dāng)下的人類參考基因組添加了1.19億堿基對(duì)和1115個(gè)基因重復(fù)(一個(gè)DNA區(qū)域里含有一個(gè)基因重復(fù)的變異)。利用這一草圖,檢測(cè)到結(jié)構(gòu)變異的數(shù)量增加了104%,為人類基因組遺傳多樣性提供了更完整的圖景。

  兩篇同時(shí)發(fā)表的文章提出了使用人類泛基因組草圖的相關(guān)發(fā)現(xiàn)。其中,美國(guó)華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院開(kāi)發(fā)了一個(gè)有片段重復(fù)序列的單核苷酸變異(SNV)圖譜,描述了數(shù)百萬(wàn)此前未繪制的SNV和與單一DNA不同的變異性質(zhì)。田納西大學(xué)衛(wèi)生與人文科學(xué)學(xué)院則觀察了異源著絲粒染色體短臂(中節(jié)位于靠近染色體一端)間的重組模式,為一種染色體之間的DNA交換機(jī)制提供了證據(jù)。這種機(jī)制過(guò)去曾推測(cè)存在,但因缺乏合適數(shù)據(jù)未觀測(cè)到。

  這些成果還只是人類泛基因組前景中的一個(gè)過(guò)渡階段,該計(jì)劃旨在到2024年年中獲取350名遺傳多樣性個(gè)體數(shù)據(jù)。同時(shí)發(fā)表的觀點(diǎn)文章提出,還需克服一些現(xiàn)有的挑戰(zhàn),如要更多樣化地取樣,這最終將為更多人的健康帶來(lái)益處。■

 

 

《科學(xué)新聞》 (科學(xué)新聞2024年2月刊 封面)
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