作者:記者 陳歡歡 來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-9-13 3:48:22
中國(guó)科學(xué)院院士趙國(guó)屏:
越是重大意外發(fā)現(xiàn) 越需要多層次重復(fù)

   《自然》雜志曾對(duì)1576名研究人員進(jìn)行過(guò)一次在線問(wèn)卷調(diào)查。結(jié)果顯示,超過(guò)70%的科學(xué)家在嘗試重復(fù)別人的實(shí)驗(yàn)時(shí)失敗,一半以上甚至無(wú)法還原自己的實(shí)驗(yàn)。

   實(shí)驗(yàn)重復(fù)到底有多重要?為什么實(shí)驗(yàn)結(jié)果會(huì)重復(fù)不了?在進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn)時(shí)要注意什么?中國(guó)科學(xué)院院士、分子微生物學(xué)家趙國(guó)屏在接受采訪時(shí)表示,越是“重大意外”發(fā)現(xiàn),越需要“多層次重復(fù)”。他結(jié)合自身經(jīng)驗(yàn),提出許多實(shí)操建議。

 

   問(wèn):在您所從事的生物學(xué)研究中,重復(fù)實(shí)驗(yàn)對(duì)確保結(jié)果正確性有多重要?

   趙國(guó)屏:可重復(fù)的重要性是毋庸置疑的。實(shí)驗(yàn)科學(xué)區(qū)別于其他科學(xué)研究的核心,就是在可以控制的條件下,以可以重復(fù)的實(shí)驗(yàn)方法,去發(fā)現(xiàn)或認(rèn)識(shí)物質(zhì)運(yùn)動(dòng)的規(guī)律。這里有兩個(gè)關(guān)鍵詞,一是“條件可控”,二是“可以重復(fù)”。

   我在大學(xué)學(xué)電鏡的時(shí)候,老師給我們看過(guò)一張圖,可能很多人都看過(guò)——《美女還是巫婆》。這張圖從不同視角看結(jié)論是不一樣的。因此,老師說(shuō),“看電鏡照片,你想看到什么就會(huì)看到什么;沒(méi)有其他相應(yīng)的證據(jù),僅憑‘看到的結(jié)果’不能說(shuō)明問(wèn)題。”這也是我們開(kāi)展實(shí)驗(yàn)科學(xué)的意義所在,通過(guò)多視角、多層次的重復(fù),驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)所揭示“認(rèn)知”的準(zhǔn)確性、客觀性。

   “條件可控”是“可以重復(fù)”的前提,在生命科學(xué)研究中有多種控制條件的方法。一是隔離,就是把“體內(nèi)”復(fù)雜系統(tǒng)中的某些問(wèn)題放到細(xì)胞、亞細(xì)胞或者分子層次上,進(jìn)行“體外”實(shí)驗(yàn)研究。二是設(shè)置對(duì)照,生命運(yùn)動(dòng)涉及因素繁多,且往往互相影響,可以使用“對(duì)照”的辦法控制條件。但每次只比對(duì)一個(gè)條件,而且盡可能控制其他條件不變,也不容易。三是正確的檢測(cè)方法,譬如,盡可能獲得定量數(shù)據(jù),注意數(shù)據(jù)檢測(cè)的線性范圍,注意采集序貫而非簡(jiǎn)單重復(fù)數(shù)據(jù)等。上述三個(gè)方面,都是為了在不同層次上保證實(shí)驗(yàn)(數(shù)據(jù))可以被重復(fù)。

 

   問(wèn):雖然重復(fù)如此重要,但是《自然》雜志曾做過(guò)一次問(wèn)卷調(diào)查,結(jié)果顯示,超過(guò)70%的科學(xué)家無(wú)法重復(fù)別人的實(shí)驗(yàn),一半以上無(wú)法還原自己的實(shí)驗(yàn)。您認(rèn)為出現(xiàn)這兩種情況的原因是什么?對(duì)于重復(fù)不了的實(shí)驗(yàn),應(yīng)該如何理性看待?

   趙國(guó)屏:這兩種情況比較常見(jiàn),并不奇怪,但是原因很復(fù)雜,可能有多個(gè)不同層次的答案。

   需要強(qiáng)調(diào),這種討論必須首先排除主觀的“學(xué)術(shù)不端”。數(shù)據(jù)造假或者“刻意”修改數(shù)據(jù)的“實(shí)驗(yàn)結(jié)果”自然無(wú)法重復(fù)。造假是嚴(yán)重的學(xué)術(shù)不端行為,是絕對(duì)不能容忍的,一造假就斷送了一生的學(xué)術(shù)生涯。所以,判定造假需要充分的證據(jù),包括認(rèn)定“造假動(dòng)機(jī)”。

   不可重復(fù)并不意味著一定造假了,也可能是認(rèn)識(shí)不足、方法局限、操作不當(dāng)?shù)人鶎?dǎo)致的,常常表現(xiàn)為“不可完全重復(fù)”。在生命科學(xué)研究中,最常見(jiàn)的原因往往與上述三個(gè)“控制條件”不完備有關(guān)。這方面我自己就有很多經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn)。

   我的一位學(xué)生曾經(jīng)在體外實(shí)驗(yàn)中,“證實(shí)”了國(guó)外研究者提出的一個(gè)調(diào)控因子磷酸化的假說(shuō),并向期刊投稿。審稿人提出,相應(yīng)的體內(nèi)表型數(shù)據(jù)不充分。該學(xué)生因此開(kāi)始懷疑自己以往的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,在重復(fù)實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)過(guò)去結(jié)論是“假陽(yáng)性”,換了一種方法后,結(jié)果正相反。最后,他又用了兩年時(shí)間,通過(guò)結(jié)構(gòu)生物學(xué)、生化分子生物學(xué)(體外)以及遺傳與生理(體內(nèi))等實(shí)驗(yàn),綜合證明了“不能磷酸化”這個(gè)“真陰性”的結(jié)果,發(fā)表了很好的論文。

   類似的例子很多。檢測(cè)方法、試劑和樣品的取樣及存儲(chǔ)條件等都會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可重復(fù)性。有些生化試劑不穩(wěn)定,放置一段時(shí)間濃度會(huì)改變,如果不校準(zhǔn)濃度,結(jié)果自然無(wú)法完全重復(fù)。

   再如,實(shí)驗(yàn)室測(cè)酶活的方法一般都是標(biāo)準(zhǔn)化的,但研究中往往使用突變的酶,活性不是高就是低,并不“標(biāo)準(zhǔn)”。如果不針對(duì)具體情況調(diào)整檢測(cè)方法,實(shí)驗(yàn)結(jié)果也不能重復(fù)。

   當(dāng)然,即便“能重復(fù)”的實(shí)驗(yàn),也不見(jiàn)得都是正確的或者“真的”。我的實(shí)驗(yàn)室曾經(jīng)在某“結(jié)構(gòu)域假說(shuō)”的指引下,認(rèn)為我們所研究的酶應(yīng)該是四聚體,并得到了“分子篩”實(shí)驗(yàn)測(cè)定的分子量證實(shí)。但十幾年過(guò)去,在AlphaFold2指導(dǎo)下,我們預(yù)測(cè)了三維結(jié)構(gòu),認(rèn)識(shí)到這個(gè)酶應(yīng)該是二聚體,并被近年發(fā)展起來(lái)的更精準(zhǔn)的測(cè)定方法所證實(shí),推翻了自己以前的結(jié)論,F(xiàn)在回頭看,當(dāng)時(shí)只覺(jué)得結(jié)果“符合假說(shuō)”就認(rèn)可了,沒(méi)認(rèn)識(shí)到這是由于低分辨率帶來(lái)的“假象”。現(xiàn)在我們正準(zhǔn)備寫(xiě)文章,不僅糾正過(guò)去的錯(cuò)誤,更將為這一大類酶結(jié)構(gòu)功能的關(guān)系提供全新的知識(shí)模型。

   不管怎么說(shuō),科學(xué)研究是可能犯錯(cuò)誤的。我們既要努力規(guī)避錯(cuò)誤,也要在犯錯(cuò)誤之后認(rèn)真改正,提升研究水平。把心思放到探尋科學(xué)規(guī)律的本質(zhì)上,才是應(yīng)有的科學(xué)態(tài)度。

 

   問(wèn):您的實(shí)驗(yàn)室對(duì)重復(fù)實(shí)驗(yàn)有何要求?能否給年輕科研人提供一些經(jīng)驗(yàn)指導(dǎo)?

   趙國(guó)屏:我們實(shí)驗(yàn)室有句老話:如果你有意外的重要發(fā)現(xiàn),第一件事情就是去重復(fù)。越是“重大意外”發(fā)現(xiàn),越不能頭腦發(fā)熱。

   在生命科學(xué)研究實(shí)踐中,的確有一些重大突破來(lái)自于實(shí)驗(yàn)或觀測(cè)的“意外”。但是,更多的意外是人為“錯(cuò)誤”所致,而且很難找到原因。所以當(dāng)一個(gè)研究者發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)意外,尤其是“意外”可能孕育著重大或重要發(fā)現(xiàn)時(shí),就一定要在多個(gè)層次上考查其“可重復(fù)性”。

   這方面的教訓(xùn)是常見(jiàn)的。有一次,一個(gè)學(xué)生興沖沖地告訴我,發(fā)現(xiàn)用大腸桿菌表達(dá)的細(xì)菌的溶血素可以誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。這可是幾十年來(lái)沒(méi)見(jiàn)過(guò)的“大發(fā)現(xiàn)”。我問(wèn)她用的什么做對(duì)照,她回答說(shuō)是生理鹽水。我提醒她自己想想這樣對(duì)照行不行。學(xué)生很不錯(cuò),馬上回去用攜帶載體質(zhì)粒的大腸桿菌提取“純化”蛋白做對(duì)照,結(jié)果同樣引起凋亡,說(shuō)明是大腸桿菌表面脂多糖引起的細(xì)胞凋亡,與溶血素?zé)o關(guān)。

   因此,所謂的重復(fù)實(shí)驗(yàn)有兩層不同含義。一種是最基本的,就是重復(fù)做同樣的實(shí)驗(yàn)。這屬于最低水平的重復(fù),目的是糾正操作誤差。但是,現(xiàn)在實(shí)驗(yàn)技術(shù)越來(lái)越先進(jìn),操作誤差比較好控制,最致命的是系統(tǒng)誤差。要避免這方面問(wèn)題,最重要的是不斷總結(jié)經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn),打好基礎(chǔ)。

   我剛到美國(guó)讀研時(shí),老師給我的第一個(gè)任務(wù)是測(cè)定一個(gè)中和抗體的滴度。我測(cè)了一周,發(fā)現(xiàn)誤差達(dá)到25%。雖然導(dǎo)師說(shuō)可以,但我覺(jué)得不對(duì)勁,就申請(qǐng)了一周重復(fù)實(shí)驗(yàn),不管怎么重復(fù)誤差還是很大。最后一天,我真絕望了。但是,我意識(shí)到一定不是操作誤差,就到圖書(shū)館去查以前的論文,終于發(fā)現(xiàn)自己的數(shù)據(jù)根本不在線性范圍內(nèi);氐綄(shí)驗(yàn)室,一調(diào)整實(shí)驗(yàn)方法,問(wèn)題就解決了。第二天拿給導(dǎo)師看,他非常高興。后來(lái)他跟我說(shuō),如果一開(kāi)始就告訴我問(wèn)題在哪里,我很快就會(huì)忘記,只有自己從失敗中總結(jié)出來(lái)的經(jīng)驗(yàn),才一輩子都不會(huì)忘記。

   我現(xiàn)在指導(dǎo)學(xué)生的時(shí)候,會(huì)單獨(dú)教一些比較特殊的測(cè)定。有的學(xué)生跟我說(shuō):“趙老師你教的跟教科書(shū)不一樣。”其實(shí),教科書(shū)往往是從“傳授知識(shí)”的角度闡述前人總結(jié)的規(guī)律,而后來(lái)者只有經(jīng)過(guò)自己的實(shí)踐,才能真正理解。

   我現(xiàn)在70多歲了,在科學(xué)研究中,絕大部分時(shí)間依然是在“摸索”。比如我老師留下的一個(gè)重要研究課題,經(jīng)過(guò)幾代研究生的努力、換了多種方法,雖然有進(jìn)展,但依然沒(méi)有真正突破,我還在努力。

   我們對(duì)客觀世界的認(rèn)識(shí)相對(duì)來(lái)說(shuō)總有片面性、局限性,所以需要不斷研究,在反復(fù)的實(shí)驗(yàn)及證偽過(guò)程中提煉真知。這才是對(duì)待實(shí)驗(yàn)的科學(xué)態(tài)度!

 

《科學(xué)新聞》 (科學(xué)新聞2022年8月刊 封面)
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