作者:記者 韓揚眉 來源: 發(fā)布時間:2020-9-13 6:37:43
為海洋生物繪制基因組圖譜
——記海洋生物過程認知新突破

   封海而衰、開海則盛。在海洋強國建設(shè)中,海洋經(jīng)濟開發(fā)是不可缺少的重要支撐。

   自上世紀50年代起,海洋所面向深海大洋,逐步揭開海洋生物神秘面紗,挖掘海洋寶藏。70年來,他們砥礪奮進,開辟了一條從基礎(chǔ)研究,到技術(shù)應(yīng)用、良種良品開發(fā),再到推廣示范的發(fā)展之路,實現(xiàn)中國海洋生物認知從無到有、海洋經(jīng)濟從弱到強的華麗嬗變。

 

國際牡蠣研究的“分水嶺”

 

   海洋所建所之初,便是從水產(chǎn)科學(xué)起步。

   上世紀50年代到80年代,建所“元老”之一的曾呈奎,對經(jīng)濟海藻資源的開發(fā)利用和化學(xué)加工,以及對紫菜、海帶栽培生物學(xué)研究取得的成果,為中國藻類、海帶栽培及化工生產(chǎn)事業(yè)的建立和發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。在1985年,我國就已成為世界上頭號海帶養(yǎng)殖生產(chǎn)大國。

   “那時主要為了解決餓肚子的問題,水產(chǎn)產(chǎn)業(yè)得到了快速發(fā)展,曾先生也引領(lǐng)了我國一大批科研人員開始從事經(jīng)濟水產(chǎn)生物的研究。”海洋所研究員張國范說。

   張國范便是追隨者之一。

   他長期從事貝類遺傳育種與養(yǎng)殖技術(shù)研發(fā),曾3次獲得國家科技進步獎二等獎。2002年,在導(dǎo)師張福綏院士的具體建議下,他開始從事中國傳統(tǒng)四大養(yǎng)殖貝類的“老大難”——牡蠣的研究。

   在國家自然科學(xué)基金的支持下,他帶領(lǐng)團隊與美國Rutgers大學(xué)教授郭希明合作,首先基本查清了中國經(jīng)濟牡蠣的種類組成和地理分布,為牡蠣基礎(chǔ)研究、遺傳改良和養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展鋪平道路。

   上世紀80年代,人類基因組計劃的啟動拉開了生命基因組研究的序幕。而“農(nóng)業(yè)以良種為先”,為了獲得品質(zhì)更優(yōu)、產(chǎn)量更高、抗性更強的水產(chǎn)品種,美國農(nóng)業(yè)部于1997年啟動了大馬哈魚、羅非魚、鯰魚、牡蠣和對蝦 5種水產(chǎn)養(yǎng)殖動物基因組計劃。

   “基因組育種是未來育種的主流發(fā)展方向”,這是張國范一直認定的。

   2008年,他邀請郭希明教授共同發(fā)起了國際牡蠣基因組計劃(OGP)。

   牡蠣基因組有著高多態(tài)性和高重復(fù)序列的特點,也沒有近緣物種基因組信息可供參考,難度巨大,他們備受質(zhì)疑。但張國范抱著“爭取第一,作出原創(chuàng)”的信念,與團隊成員日夜奮戰(zhàn),整理實驗數(shù)據(jù)和論文時更是“全面閉關(guān)”近一年。

   終于,2012年9月19日,他們向全球公布了世界上首個貝類全基因組序列精細圖譜,揭示了基因家族的特異性擴張是牡蠣適應(yīng)環(huán)境異質(zhì)性的組學(xué)機制,《自然》雜志以長文形式在線刊發(fā)。

   中國貝類適應(yīng)進化研究步入國際前沿。國際牡蠣研究泰斗Bayne評價稱,該研究為“牡蠣生物學(xué)研究的分水嶺”。在此基礎(chǔ)上,團隊還搭建了牡蠣資源基因組研發(fā)平臺,相繼發(fā)表了系列高水平研究論文,建立了牡蠣品質(zhì)性狀基因模塊育種技術(shù),為高質(zhì)牡蠣產(chǎn)品創(chuàng)制奠定了基礎(chǔ)。

 

對蝦研究突破國外“封鎖”

 

   21世紀伊始,海洋所研究員相建海和李富花主導(dǎo)的研究團隊開啟了對蝦基因組研究。

   對蝦是高蛋白、低脂肪的優(yōu)質(zhì)水產(chǎn)品種,我國是全球?qū)ξr養(yǎng)殖和消費第一大國,每年對蝦養(yǎng)殖產(chǎn)量達160萬噸,產(chǎn)值近千億元。

   “對蝦研究始于國家需求,傳承前輩衣缽。”李富花回憶說。

   1993年,一種名為“白斑桿狀病毒”的蝦病席卷全國,我國對蝦從20萬噸的年產(chǎn)量一度跌至5萬噸。病毒傷了養(yǎng)蝦人,也刺痛了海洋所對蝦研究者。當時,海洋所研究員張偉權(quán)及其團隊在劉瑞玉院士倡導(dǎo)下從美國引進了凡納濱對蝦并開展人工育苗研究。

   “從美國引進的凡納濱對蝦在一定程度上救了我國對蝦養(yǎng)殖,但優(yōu)質(zhì)種源問題卻始終受制于人。”相建海坦承,為維持產(chǎn)業(yè)發(fā)展,國內(nèi)育苗企業(yè)每年需要從國外進口種蝦,費用高達 3 億元,“為了不被‘卡脖子’,我們必須培育自己的品種”。

   在長達近10年的時間里,他們經(jīng)歷了無數(shù)次的篩選、反復(fù)、等待……首先針對對蝦獨特的生物學(xué)特點,開創(chuàng)了對蝦細胞工程育種技術(shù),在國際上首次成功批量誘導(dǎo)出中國對蝦的三倍體,為對蝦良種創(chuàng)制和良種保護提供了技術(shù)基礎(chǔ)。

   傳統(tǒng)遺傳育種周期長、效益慢,育種失敗率高。全力破譯凡納濱對蝦的基因密碼,可以提高育種的準確性,從而加快選育進程。

   對蝦基因組大、重復(fù)序列和雜合度高,此前多個從事對蝦基因組研究的國際團隊相繼退出。

   敢啃“硬骨頭”,是海洋所人的特質(zhì)。他們“二十年磨一劍”,終于成功破譯凡納濱對蝦基因組,構(gòu)建了全球目前唯一的一個凡納濱對蝦BAC(細菌人工染色體)文庫,獲得國際首個高質(zhì)量對蝦基因組參考圖譜,研究成果于2019年發(fā)表在《自然—通訊》雜志。

   基于該研究,團隊還建立了基于分子標記和功能基因的分子育種技術(shù),為對蝦基因組育種和經(jīng)濟性狀改良工作提供了重要的基礎(chǔ)平臺。

   “分子育種使得今后選育新品種過程可能縮短至3~5年,還可根據(jù)目標需求育出不同品種,滿足多元化的市場需求。”相建海說。

 

良品良種 事業(yè)未竟

 

   繪制基因圖譜,打開海洋生物生命認知之門。除了牡蠣、對蝦,海洋所還在國際上首次完成了仿刺參基因組測序和組裝,其他重要經(jīng)濟水產(chǎn)生物的基因組也正在研究中。

   “不談基礎(chǔ),何談應(yīng)用。”仿刺參基因組研究主要完成人之一、海洋所常務(wù)副所長楊紅生一語道破基礎(chǔ)研究的重要性,“生物過程的認知,包括基因組研究,是我們海洋生物資源開發(fā)利用的基礎(chǔ)。”

   近年來,海洋所在我國海洋生物資源認知上取得的新突破,極大促進了新品種和新生產(chǎn)體系上的大突破。

   張國范與李莉等團隊成員一道在基因組研究的基礎(chǔ)上,建立了品質(zhì)性狀基因模塊育種技術(shù),育成“海蠣1號”高糖原牡蠣新品種。連續(xù)兩年生產(chǎn)測試對比結(jié)果表明,“海蠣1號”養(yǎng)殖效益較常規(guī)品種提高2~3倍。長牡蠣“海蠣1號”新品種目前已通過全國水產(chǎn)原種和良種審定委員會的審定。

   記者眼中的張國范是一位儒雅科學(xué)家,但他始終強調(diào)自己是一位“農(nóng)民”,他心中裝的也是“如何讓農(nóng)民富裕起來”。通過多種技術(shù)的集成和優(yōu)化,他們團隊建立了具有國際影響力的高質(zhì)牡蠣創(chuàng)制理論和技術(shù)體系,并在縣域(威海乳山)規(guī)模進行一體化應(yīng)用示范,支撐了全國行業(yè)第一品牌“乳山牡蠣”的形成和發(fā)展。

   “肉質(zhì)肥美、清冽爽滑、個大飽滿,一點不輸國外頂尖牡蠣品牌。”張國范自豪地說。

   在對蝦產(chǎn)業(yè)方面,相建海團隊首次在對蝦中建立了四系配套育種技術(shù)體系,培育出快長系、高存活/高繁系、高存活/快長系和高繁系4個品系,培育出凡納濱對蝦“科海1號”和“廣泰1號” 新品種,近兩年,兩大品種在我國主要養(yǎng)殖區(qū)域推廣健康苗種100億余尾。

   在刺參方面,楊紅生團隊構(gòu)建了刺參等良種選育技術(shù)平臺,培育出“東科1號”耐溫速生新品種和3個優(yōu)良經(jīng)濟性狀的新品系。此外,他們研發(fā)并建立了刺參等重要海水經(jīng)濟動物的多元生態(tài)高效增養(yǎng)殖新技術(shù)。

   科研是漫長的,趕海是艱辛的,但這些農(nóng)民式的科學(xué)家樂在其中、樂此不疲。向海而作,他們事業(yè)未竟。

 

 

《科學(xué)新聞》 (科學(xué)新聞2020年8月刊 碩果)
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