中國科學(xué)院自然科學(xué)史研究所自創(chuàng)建伊始就致力于整理和研究中國科學(xué)技術(shù)遺產(chǎn)，開展了許多專題研究，取得了諸多重要研究成果。
比如，席澤宗等人在古新星、超新星方面的研究蜚聲國際天體物理學(xué)界和天文學(xué)史界，華覺明等人于上世紀(jì)80 年代主持的“曾侯乙編鐘復(fù)原研究”獲文化部重大科技成果一等獎。此外，薄樹人和陳久金對天文學(xué)史的研究，杜石然對中國科技通史的研究，潘吉星對中國四大發(fā)明史的研究，曹婉如和鄭錫煌的地理學(xué)和制圖學(xué)史研究，郭書春的《九章算術(shù)》研究，戴念祖的中國古代物理學(xué)史研究，董光璧的中國近現(xiàn)代科技史研究，許良英對愛因斯坦與20 世紀(jì)物理學(xué)史的研究以及一批中年專家的研究工作，都在學(xué)術(shù)界產(chǎn)生了很大的影響。
同時，自然科學(xué)史研究所專家撰寫的多本著作都被譯成外文出版，或直接以外文出版，如《中國古代數(shù)學(xué)簡史》（李儼、杜石然）《中國數(shù)學(xué)史》（錢寶琮）《中國古代造紙技術(shù)史稿》（潘吉星）《中國古代建筑技術(shù)史》（張馭寰主編）《中國科學(xué)技術(shù)史稿》（杜石然等）《中國科學(xué)技術(shù)史·醫(yī)學(xué)卷》（廖育群）以及《漢代星空》（孫小淳）等等。
自1990 年以來，自然科學(xué)史研究所平均每5年承擔(dān)1~2項中國科學(xué)院重大研究項目，并組織所內(nèi)研究人員與國內(nèi)外學(xué)者合作，共同完成項目。這些項目反映了研究活動的主線和產(chǎn)出成果的基本態(tài)勢，因此研究所的科研工作也主要圍繞這些項目展開。
1990~2010 年間是研究所出成果比較集中的一個時期。1990 年，“中國古代科學(xué)技術(shù)史研究”被中國科學(xué)院立項為“八五”重點研究項目。在陳美東研究員的主持下，百余名中國科技史家陸續(xù)撰寫了28卷本《中國科學(xué)技術(shù)史》（盧嘉錫主編）。
作為領(lǐng)域內(nèi)最突出的成果之一，《中國科學(xué)技術(shù)史》叢書反映了科技史研究與考古發(fā)現(xiàn)的新成果，分學(xué)科與門類展示了中國古代科學(xué)技術(shù)的發(fā)展歷程與主要成就，代表著國內(nèi)科技史研究的最高水平。由于它足以與李約瑟主編的《中國科學(xué)技術(shù)史》（Science and Civilisation in China）媲美，因而被認為改變了以往國內(nèi)主要靠李約瑟闡釋中國科技傳統(tǒng)的局面。其中，郭書春主編的數(shù)學(xué)史卷和席澤宗主編的科學(xué)思想史卷分別獲得中國歷史學(xué)最高獎——郭沫若歷史學(xué)獎一等獎和二等獎。同樣獲郭沫若歷史學(xué)獎二等獎的還有張秀民、韓琦的《中國印刷史》。
這一時期，自然科學(xué)史研究所的專家們還主持或合作撰寫了若干分學(xué)科的總結(jié)性叢書，包括《中國天文學(xué)史大系》《中國物理學(xué)史大系》《中國數(shù)學(xué)史大系》等，同時整理了古代文獻，出版了共50 卷的《中國科學(xué)技術(shù)典籍通匯》，完成了一項非常重要的基礎(chǔ)工作。
1996 年后，“中國傳統(tǒng)技術(shù)綜合研究”被中國科學(xué)院立項為“九五”重大研究項目。該項目分為傳統(tǒng)工藝與古代工程技術(shù)史兩個系列，分別由華覺明和何堂坤主持，由百余名國內(nèi)技術(shù)史家和文化遺產(chǎn)學(xué)者共同承擔(dān)完成，主要研究成果為16 卷本《中國古代工程技術(shù)史大系》（路甬祥主編）和20 卷本《中國傳統(tǒng)工藝全集》（路甬祥主編）。其中，《中國傳統(tǒng)工藝全集》分門別類地調(diào)查和研究了中國的傳統(tǒng)工藝，出版后成為國家文化部門調(diào)查和保護傳統(tǒng)工藝、文物與遺址等文化遺產(chǎn)的重要學(xué)術(shù)依據(jù)，并獲得國家新聞出版總署最高圖書獎——“中華優(yōu)秀圖書獎”。
自1978 年起，自然科學(xué)史研究所就開始研究近現(xiàn)代科技史，先后出版了《20 世紀(jì)科學(xué)技術(shù)簡史》（李佩珊、許良英主編）《貝爾實驗室》（閻康年）《中國近現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)史》（董光璧主編）和《中國近現(xiàn)代技術(shù)簡史》（吳熙敬主編）等專著。2001 年，中國科學(xué)院將自然科學(xué)史研究所籌劃的“中國近現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)發(fā)展綜合研究”列為知識創(chuàng)新工程重要方向項目。在張柏春、王揚宗的主持下，110 名所內(nèi)外專家學(xué)者進行了36 項專題研究，完成35 卷本的《中國近現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)史研究叢書》（路甬祥主編）。該叢書開創(chuàng)了中國近現(xiàn)代科技史研究的新局面，推動了該領(lǐng)域?qū)W術(shù)共同體的發(fā)展。其中，《蘇聯(lián)技術(shù)向中國的轉(zhuǎn)移》《中國航天技術(shù)發(fā)展史稿》等書被選譯成俄文并在圣彼得堡出版。
1999年，在中國科學(xué)院的鼓勵下，自然科學(xué)史研究所開始嘗試以史學(xué)為基礎(chǔ)的科技戰(zhàn)略研究，包括整理和編輯《中國科技政策資料選輯》，出版《中國科技規(guī)劃、計劃與政策研究》（文集），參與中國科學(xué)院面向2050 年的科技戰(zhàn)略研究，參與中國科學(xué)院與國家自然科學(xué)基金委員會組織的學(xué)科發(fā)展戰(zhàn)略研究，為起草《未來10 年中國學(xué)科發(fā)展戰(zhàn)略》《創(chuàng)新2050》《科技發(fā)展新態(tài)勢與面向2020 年的戰(zhàn)略選擇》《亞洲可持續(xù)發(fā)展研究報告》等戰(zhàn)略研究報告做出了重要貢獻。
2001年起，自然科學(xué)史研究所進一步開拓新的研究領(lǐng)域，將科技史、科技戰(zhàn)略、科學(xué)文化列為研究所的三個主要方向。其中，科學(xué)文化研究旨在為建設(shè)科學(xué)文化、整合科學(xué)與人文做出貢獻，同時擴大研究所的社會影響，爭取公眾與權(quán)威部門對研究所的理解及支持。2004 年，研究所與中國科學(xué)院規(guī)劃戰(zhàn)略局合作創(chuàng)辦期刊《科學(xué)文化評論》，同年底開展傳統(tǒng)工藝與文物科技研究，以適應(yīng)國家文化遺產(chǎn)調(diào)查與保護工程的需求。
2004年起，研究所的近現(xiàn)代科技史學(xué)者逐步將目光轉(zhuǎn)向中國科學(xué)院歷史的研究和編著，以及“中國西北科學(xué)考察團的綜合研究”（羅桂環(huán)主持）“中國近現(xiàn)代生物學(xué)史”（羅桂環(huán)主持）“中外科學(xué)技術(shù)發(fā)展的比較”（張柏春主持）等專題研究，并參與組織口述史研究與科學(xué)家資料的采集與整理等工作。這方面的成果包括《中國科學(xué)院人物傳》《中國西北科學(xué)考查團綜論》《中國西北科學(xué)考查團專論》以及《技術(shù)轉(zhuǎn)移與技術(shù)創(chuàng)新歷史叢書》等。
長期以來，研究所承擔(dān)了多項國家重大文化研究項目。1996 年，科技部啟動“夏商周斷代工程”，席澤宗受聘出任該項目的首席科學(xué)家，主持研究天象記錄，以天文學(xué)手段推定重大歷史事件的絕對年代。2001 年5 月，該項目獲科技部等四部委聯(lián)合頒發(fā)的重大科技成果獎。2002 年，文化部啟動“清史纂修工程”，席澤宗、韓琦等分別承擔(dān)清史“天文志”和“科技志”的纂修。2006 年，郭書春主持國家新聞出版總署立項的國家重大文化工程《中華大典·數(shù)學(xué)典》的編修工作。
在國際合作方面，20世紀(jì)80 年代，研究所的國際合作開始從個人合作逐步發(fā)展到機構(gòu)間合作，并產(chǎn)出了一批有影響力的合作成果。如郭書春與法國科研中心教授林力娜合作完成的中法對照本《九章算術(shù)》（2004 ）于2006 年獲得法蘭西學(xué)院的平山郁夫獎；2001 年起，研究所與德國馬普學(xué)會科學(xué)史研究所建立伙伴小組，兩國學(xué)者合作出版了《轉(zhuǎn)變與傳播》和《傳播與會通》。
50余年來，自然科學(xué)史研究所在中國古代數(shù)學(xué)史、天文學(xué)史、物理學(xué)史、化學(xué)史、地學(xué)史、生物學(xué)史、技術(shù)史與中外科技交流史、醫(yī)學(xué)史等領(lǐng)域的許多方面做了深入的專題研究，并在中國近現(xiàn)代科技史領(lǐng)域做出了一些開創(chuàng)性的研究工作，共撰寫、編輯和出版著作400余部，發(fā)表論文及作品5000 余篇，50 多部著作獲國家級圖書獎、中國科學(xué)院自然科學(xué)獎以及省部委科技成果獎。2008~2013 年間，研究所在職研究人員共出版專著和其他書籍83 部，發(fā)表論文483 篇，其中外文48 篇。2010~2013 年間，研究所離退休專家共出版論著36 余部。
在科研工作之外，自然科學(xué)史研究所還發(fā)揮學(xué)科特長，向社會公眾開展了多種形式的科普工作。如舉辦“中國古代科技成就”“科學(xué)之門——從諾貝爾獎看二十世紀(jì)科技發(fā)展”“中德科技合作”“愛因斯坦的世界——愛因斯坦奇跡年百年展”等大型圖展，還以演講、著述和翻譯國外名著的形式，積極向社會傳播科學(xué)文化，參與制作《龍騰》大型系列片（中英合作），擴大了研究所的社會影響力。
2011年以來，研究所啟動“一三五”規(guī)劃，研究工作主要圍繞“三個突破”和“五個重點培育”展開，探索新的研究方法與范式，項目組和研究所開展系列研討活動；學(xué)術(shù)交流活躍，研究所、研究室和研究中心組織多樣的學(xué)術(shù)報告會、講座、論壇等活動，邀請許多國內(nèi)外學(xué)者參與交流或作報告；雙邊或多邊的國際研討活躍，且注重解決學(xué)術(shù)問題，青年學(xué)者得到鍛煉；體現(xiàn)“一三五”布局的研究成果逐漸增多，研究人員和研究生參加國際會議較多，取得良好成效；部分研究人員被邀請到大學(xué)、培訓(xùn)學(xué)院或中學(xué)授課�！�
（本文由中國科學(xué)院自然科學(xué)史研究所提供）