有關(guān)遠(yuǎn)古埃塞俄比亞人基因組文章的勘誤
《科學(xué)》雜志將對2015年10月8日的網(wǎng)絡(luò)版報告“遠(yuǎn)古埃塞俄比亞人基因組揭示了在整個非洲大陸的廣泛的歐亞混合”刊登一則勘誤啟示。
這項研究的結(jié)果受到了作者所犯的生物信息學(xué)錯誤的影響。他們得出的從歐亞大陸西部遷徙到非洲東部——或更精確地說從一個基因來源接近于早期新石器農(nóng)耕者——的結(jié)論沒有受到影響。
然而，這一遷徙的遺傳學(xué)影響的地理范圍則被高估：從歐亞大陸西部的返流主要影響的是東非和只有少數(shù)的撒哈拉以南人群。因此，所發(fā)表文章的標(biāo)題和摘要沒有精確地表述該混合的地理范圍，它們都已經(jīng)得到了相應(yīng)的更正。
利用腸道真菌分解生物質(zhì)
研究人員記錄一個由真菌分泌的能分解植物生物質(zhì)的酶庫，并描繪了這些酶是如何發(fā)揮協(xié)同功能的。這些結(jié)果或能幫助簡化生物燃料的生產(chǎn)并降低其生成成本。
木質(zhì)纖維素或植物干物質(zhì)是地球上可得到的最豐富的能用于生產(chǎn)生物燃料（包括乙醇）的材料。然而，目前將這樣的生物質(zhì)轉(zhuǎn)變?yōu)槿剂系姆椒ㄐ枰嘿F的預(yù)處理工藝。存在于食草動物腸道內(nèi)的真菌能高效地分解木質(zhì)纖維素。
因此，Kevin Solomon等人采集了有著不同飲食的食草哺乳動物的糞便樣本，分離了3種先前未被鑒定的培養(yǎng)物：粗壯厭氧鞭菌、加利福尼亞新美鞭菌及菲尼斯瘤胃壺菌。
來自這些真菌的酶的分解木質(zhì)纖維素的能力堪比那些目前所用的市售酶，并在有些時候其性能甚至超越這些市售酶。作者的數(shù)據(jù)表明，某些酶能快速起效及密切協(xié)調(diào)以分解植物細(xì)胞堅固的外層。
為了對這一協(xié)同作用有更多的了解，他們讓培養(yǎng)的瘤胃壺菌接受一劑葡萄糖，接著讓其接觸草蘆并對RNA轉(zhuǎn)錄的變化進(jìn)行監(jiān)控。通過這些變化，研究人員發(fā)現(xiàn)了17種轉(zhuǎn)錄物，它們能共同調(diào)節(jié)生物質(zhì)的降解過程，因而能充當(dāng)用于生物技術(shù)的有用的降解酶。
腸道微生物幫助維持身體成長
兩項新的研究展示了營養(yǎng)不良是如何影響腸道微生物群的，并確認(rèn)了某些特定種類的微生物能夠抵消營養(yǎng)不良的負(fù)面影響。這些發(fā)現(xiàn)對全球數(shù)百萬營養(yǎng)不良兒童具有重要意義，因為營養(yǎng)不良除了其他不良反應(yīng)外還會致使他們生長停滯。
在第一項研究中，Laura Blanton等人揭示營養(yǎng)不良是如何在嬰兒腸道中改變微生物種類的組合，而這轉(zhuǎn)而會阻礙兒童的身體成長。此外，他們發(fā)現(xiàn)了兩種微生物——當(dāng)它們被植入到腸道微生物群發(fā)育與年齡不相稱的小鼠腸道內(nèi)時——可對抗生長受損。
第二項研究發(fā)現(xiàn)了兩株腸道微生物，它們能通過生長激素信號傳導(dǎo)而影響出生后小鼠的生長，這能緩沖慢性營養(yǎng)不良造成的不良反應(yīng)。Martin Schwarzer等人先前在果蠅腸道內(nèi)發(fā)現(xiàn)了某種植物乳桿菌株會影響果蠅的生長，因此該研究團(tuán)隊在含有同樣菌株的小鼠中對這些影響進(jìn)行了探索。